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用于 CUT&RUN 和 CUT&Tag 的 CUTANA™ 檢測(cè)

高性能基因組作圖分析

用于 CUT&RUN 和 CUT&Tag 的 CUTANA™ 檢測(cè) 利用免疫束縛技術(shù)的最新進(jìn)展提供高效、超靈敏的染色質(zhì)定位能力。與表觀基因組分析的標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)方法 ChIP-seq 相比，這兩項(xiàng)激動(dòng)人心的新技術(shù)具有明顯的優(yōu)勢(shì)，包括：

需要更少的細(xì)胞每個(gè)樣本只需要 3-5 百萬個(gè)測(cè)序讀數(shù)改進(jìn)的信噪比顯著節(jié)省時(shí)間和成本

超低輸入染色質(zhì)作圖分析

CUTANA™ CUT&Tag 檢測(cè)基于免疫束縛技術(shù)的最新進(jìn)展，提供創(chuàng)新的工作流程，使用 < 5,000 個(gè)細(xì)胞對(duì)組蛋白 PTM 進(jìn)行分析。

CUT&Tag 是一項(xiàng)新興技術(shù)，其協(xié)議正在積極開發(fā)中，包括單細(xì)胞工作流程。當(dāng)使用 < 5,000 個(gè)細(xì)胞核或細(xì)胞分析組蛋白 PTM 時(shí)，這種方法是理想的。對(duì)于大多數(shù)實(shí)驗(yàn)，EpiCypher 強(qiáng)烈建議使用我們強(qiáng)大的 CUTANA™ CUT&RUN 檢測(cè)，該檢測(cè)兼容 5,000 至 500,000 個(gè)細(xì)胞，并針對(duì)各種靶標(biāo)、樣品輸入、固定條件進(jìn)行了優(yōu)化。

* 不建議將 CUT&Tag 用于染色質(zhì)相關(guān)蛋白 – 請(qǐng)改用 CUTANA CUT&RUN 檢測(cè)。

CUT&Tag 是如何工作的？

Ç leavage ü的nDer ?具體目標(biāo)和標(biāo)記心理狀態(tài)（CUT＆標(biāo)記）是一種新型的immunotethering測(cè)定中，基于切割下目標(biāo)和推出使用核酸酶（CUT＆RUN）方法。

在 CUT&Tag 中，蛋白 A、蛋白 G 和 Tn5 轉(zhuǎn)座酶的融合用于催化抗體結(jié)合染色質(zhì)上的同步切割和測(cè)序接頭連接。在 CUT&Tag 中使用 Tn5 是一個(gè)關(guān)鍵的進(jìn)步，因?yàn)檫@一步驟消除了染色質(zhì)碎裂和文庫(kù)制備的需要。

與 ChIP-seq 分析相比，CUT&Tag 分析顯示出顯著改善的信噪比 (S/N)，特別是用于在超低樣本輸入中映射組蛋白 PTM。

SNAP-ChIP ®

認(rèn)證抗體

您可以信賴的 ChIP 抗體

抗體選擇是研究人員在設(shè)計(jì) ChIP 實(shí)驗(yàn)時(shí)必須做出的最重要的決定，但嚴(yán)格的抗體驗(yàn)證既昂貴又耗時(shí)。在 EpiCypher，我們認(rèn)識(shí)到這一挑戰(zhàn)，并已著手進(jìn)行大量工作來分析和鑒定性能最高的 ChIP 抗體。

SNAP-ChIP ®認(rèn)證抗體使用 EpiCypher 專有的SNAP-ChIP ®摻入 技術(shù)進(jìn)行測(cè)試，提供針對(duì)特定核小體底物的強(qiáng)大應(yīng)用內(nèi)抗體驗(yàn)證。這種嚴(yán)格的測(cè)試可確保在您的 ChIP 實(shí)驗(yàn)中發(fā)揮可靠的性能。

低交叉反應(yīng)性知識(shí)產(chǎn)權(quán)效率高廣泛的批量測(cè)試定期添加新抗體

SNAP-ChIP ® Spike-in Controls 如何工作？

SNAP-ChIP 摻入是 DNA 條形碼重組核小體的集合，可直接添加到 ChIP 實(shí)驗(yàn)中以評(píng)估抗體特異性和效率。

在 IP 之前，spike-ins 被添加到標(biāo)準(zhǔn)的 ChIP 工作流程中。PTM 特異性 DNA 條形碼的回收率由 qPCR 或下一代測(cè)序確定，揭示脫靶相互作用和富集（與摻入的輸入染色質(zhì)）。

SNAP-ChIP：使用核小體鑒定 ChIP 抗體的平臺(tái)

抗體特異性

SNAP-ChIP ®認(rèn)證抗體經(jīng)過特異性（即交叉反應(yīng)性；左 y 軸）和富集（即回收率、效率；右 y 軸）測(cè)試，SNAP-ChIP 認(rèn)證抗體與相關(guān)抗體的交叉反應(yīng)性低于 20% PTM（藍(lán)色條）并從輸入染色質(zhì)（綠色條）中恢復(fù)至少 5% 的目標(biāo) PTM。

不符合這些標(biāo)準(zhǔn)的抗體（參見“失敗”圖）不適合 ChIP-seq，使用時(shí)應(yīng)格外小心，因?yàn)樗鼈兛赡軙?huì)導(dǎo)致不正確的生物學(xué)解釋。

為什么核小體環(huán)境很重要？

使用 SNAP-ChIP 摻入對(duì)照，我們發(fā)現(xiàn)：

常用的組蛋白 PTM 肽陣列不能預(yù)測(cè) ChIP 中的抗體性能（Shah et al. Mol. Cel 2018）。

許多被高度引用的抗體與相關(guān)標(biāo)記發(fā)生交叉反應(yīng)，導(dǎo)致錯(cuò)誤的生物學(xué)解釋（ Shah et al. 2018 and Lam et al. 2019）。

生產(chǎn)批次之間的抗體特異性可能會(huì)有很大差異（請(qǐng)參閱我們的博客）。

SNAP-ChIP ® Spike-In 控制面板

為ChIP 定義的對(duì)照。我們提供各種組蛋白 PTM 的面板，包括賴氨酸甲基化和?；?。

SNAP-ChIP ®認(rèn)證抗體

這些抗體已經(jīng)使用 SNAP-ChIP 摻入進(jìn)行了驗(yàn)證，并具有特異性和目標(biāo)富集。

SNAP-ChIP ®驗(yàn)證服務(wù)

讓專家?guī)兔Γ〗柚?span> SNAP-ChIP 驗(yàn)證服務(wù)，EpiCypher 將幫助您找到適合您的 ChIP-seq 研究的抗體。

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